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本層流傳遞窗采用微電腦控制，具有自動化程度高，配置靈活，穩定可靠等優點。可進行手動操作和自動操作兩種操作方式，自動方式快速，手動方式方便靈活。

層流傳遞窗操作步驟：

1.參數設置：同時按住風淋和滅菌按鍵一秒，進入風淋時間和滅菌時間設置狀態，設置位數碼管閃爍，照明鍵數字向上加，手動自動鍵數字向下減，滅菌鍵位置向左移，開門鍵位置身右移，按風淋鍵將存儲參數并退出。

2.傳窗方向設置：同時按住風淋和照明鍵一秒，面板開門指示燈閃爍，此時按對應面板的開門鍵，將使當前面板設置為一號門并退出。

3.模式轉換：按手動自動鍵，手動和自動模式相互轉換并且對應指示燈亮。

4.自動模式：(1)按開門鍵一號門開門指示燈亮并解鎖，此時可開一號門，二號門閉鎖。(2)打開一號門，照明將打開，取放物品后并關閉一號門，照明關閉，并啟動風淋和滅菌，顯示按設定時間倒計時，單位是分鐘。(3)風淋和滅菌倒計時到0后自動關閉，在此期間也可手動關閉。當風淋和滅菌都關閉后蜂鳴器長響兩秒，二號門指示燈亮并解鎖。(4)打開二號門，照明將打開，取放物品后并關閉二號門，照明關閉，完成一次流程，按開門鍵將從(1)步循環此流程。

5. 手動模式：(1)在關閉狀態按對應面板開門鍵可使對應門解鎖10s，在此期間對應開門指示燈亮，10s后指示燈自動熄滅并閉鎖。(2)按照明鍵將開啟和關閉照明燈。(3)在兩個門都關閉狀態下可手動開啟和關閉風淋和滅菌，在風淋或者滅菌運行期間，兩個門均閉鎖。